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A community perspective on the concept of marine holobionts: state-of-the-art, challenges, and future directions ArchiMer
Dittami, Simon M; Arboleda, Enrique; Auguet, Jean-christophe; Bigalke, Arite; Briand, Enora; Cardenas, Paco; Cardini, Ulisse; Decelle, Johan; Engelen, Aschwin; Eveillard, Damien; Gachon, Claire Mm; Griffiths, Sarah; Harder, Tilmann; Kayal, Ehsan; Kazamia, Elena; Lallier, François H; Media, Monica; Marzinelli, Ezequiel M; Morganti, Teresa; Nunez Pons, Laura; Prado, Soizik; Pintado, José; Saha, Mahasweta; Selosse, Marc-andré; Skillings, Derek; Stock, Willem; Sunagawa, Shinichi; Toulza, Eve; Vorobev, Alexey; Leblanc, Catherine; Not, Fabrice.
Host-microbe interactions play crucial roles in marine ecosystems, but we still have very little understanding of the mechanisms that govern these relationships, the evolutionary processes that shape them, and their ecological consequences. The holobiont concept is a renewed paradigm in biology that can help describe and understand these complex systems. It posits that a host and its associated microbiota, living together in a long-lasting relationship, form the holobiont, and have to be studied together, as a coherent biological and functional unit, in order to understand the biology, ecology and evolution of the organisms. Here we discuss critical concepts and opportunities in marine holobiont research and identify key challenges in the field. We...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59209/61904.pdf
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A comparative assessment of the uncertainties of global surface ocean CO2 estimates using a machine-learning ensemble (CSIR-ML6 version 2019a) - have we hit the wall? ArchiMer
Gregor, Luke; Lebehot, Alice D.; Kok, Schalk; Monteiro, Pedro M. Scheel.
Over the last decade, advanced statistical inference and machine learning have been used to fill the gaps in sparse surface ocean CO2 measurements (Rodenbeck et al., 2015). The estimates from these methods have been used to constrain seasonal, interannual and decadal variability in sea-air CO2 fluxes and the drivers of these changes (Landschutzer et al., 2015, 2016; Gregor et al., 2018). However, it is also becoming clear that these methods are converging towards a common bias and root mean square error (RMSE) boundary: "the wall", which suggests that pCO(2) estimates are now limited by both data gaps and scale-sensitive observations. Here, we analyse this problem by introducing a new gap-filling method, an ensemble average of six machine-learning models...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00676/78797/81035.pdf
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A compilation of global bio-optical in situ data for ocean-colour satellite applications - version two ArchiMer
Valente, Andre; Sathyendranath, Shubha; Brotas, Vanda; Groom, Steve; Grant, Michael; Taberner, Malcolm; Antoine, David; Arnone, Robert; Balch, William M.; Barker, Kathryn; Barlow, Ray; Belanger, Simon; Berthon, Jean-francois; Besiktepe, Suikru; Borsheim, Yngve; Bracher, Astrid; Brando, Vittorio; Canuti, Elisabetta; Chavez, Francisco; Cianca, Andres; Claustre, Herve; Clementson, Lesley; Crout, Richard; Frouin, Robert; Garcia-soto, Carlos; Gibb, Stuart W.; Gould, Richard; Hooker, Stanford B.; Kahru, Mati; Kampel, Milton; Klein, Holger; Kratzer, Susanne; Kudela, Raphael; Ledesma, Jesus; Loisel, Hubert; Matrai, Patricia; Mckee, David; Mitchell, Brian G.; Moisan, Tiffany; Muller-karger, Frank; O'Dowd, Leonie; Ondrusek, Michael; Platt, Trevor; Poulton, Alex J.; Repecaud, Michel; Schroeder, Thomas; Smythe, Timothy; Smythe-wright, Denise; Sosik, Heidi M.; Twardowski, Michael; Vellucci, Vincenzo; Voss, Kenneth; Werdell, Jeremy; Wernand, Marcel; Wright, Simon; Zibordi, Giuseppe.
A global compilation of in situ data is useful to evaluate the quality of ocean-colour satellite data records. Here we describe the data compiled for the validation of the ocean-colour products from the ESA Ocean Colour Climate Change Initiative (OC-CCI). The data were acquired from several sources (including, inter alia, MOBY, BOUSSOLE, AERONET-OC, SeaBASS, NOMAD, MERMAID, AMT, ICES, HOT and GeP&CO) and span the period from 1997 to 2018. Observations of the following variables were compiled: spectral remote-sensing reflectances, concentrations of chlorophyll a, spectral inherent optical properties, spectral diffuse attenuation coefficients and total suspended matter. The data were from multi-project archives acquired via open internet services or from...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00508/61937/66031.pdf
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A Computational Framework for Daily Power Flow Analysis Considering Photovoltaic Distributed Generation BABT
Gurski,Erico; Moraes,Fillipe Alexandre; Fritzen,Paulo Cícero; Benedito,Raphael Augusto de Souza.
Abstract In Brazil, the demand for the acquisition and installation of photovoltaic systems has grown exponentially and, with that, the importance of studies considering their effects on the distribution grids power flow also grows. Due to the intermittent nature of photovoltaic generation, it is important to approach the analysis in a discrete way, taking into account the changes in the power injections during the studied period. Thus, this article presents the daily analysis of the effects of photovoltaic generation on the distribution system through the computational implementation of a discretized power flow routine. The implemented routine can also analyze the effects of other distributed generations on distribution grids, whether those grids are...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Distributed Generation; Power Flow; Photovoltaic Systems.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132019000200207
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A consensus document for the clinical management of invasive fungal diseases in pediatric patients with hematologic cancer and/or undergoing hematopoietic stem cell transplantation in Brazilian medical centers BJID
Carlesse,Fabianne; Daudt,Liane Esteves; Seber,Adriana; Dutra,Álvaro Pimenta; Melo,Analy Salles de Azevedo; Simões,Belinda; Macedo,Carla Renata Donato; Bonfim,Carmem; Benites,Eliana; Gregianin,Lauro; Batista,Marjorie Vieira; Abramczyk,Marcelo; Tostes,Vivian; Lederman,Henrique Manoel; Lee,Maria Lúcia de Martino; Loggetto,Sandra; Castro Junior,Cláudio Galvão de; Colombo,Arnaldo Lopes.
ABSTRACT In the present paper we summarize the suggestions of a multidisciplinary group including experts in pediatric oncology and infectious diseases who reviewed the medical literature to elaborate a consensus document (CD) for the diagnosis and clinical management of invasive fungal diseases (IFDs) in children with hematologic cancer and those who underwent hematopoietic stem-cell transplantation. All major multicenter studies designed to characterize the epidemiology of IFDs in children with cancer, as well as all randomized clinical trials addressing empirical and targeted antifungal therapy were reviewed. In the absence of randomized clinical trials, the best evidence available to support the recommendations were selected. Algorithms for early...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fungal infections; Children; Cancer.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702019000600395
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A conservação de bacias e os desafios para a sustentabilidade da agricultura. Infoteca-e
FIGUEIREDO, R. de O.; GREEN, T. R..
Resumo: Esta publicação aborda a complexidade e os desafios para que se alcance a sustentabilidade no uso da terra, no tocante à conservação dos recursos hídricos e respectivas bacias hidrográficas. Trata da dinâmica de alterações nos processos biogeoquímicos e hidrológicos presentes nas bacias onde o ecossistema natural é modificado. Considera, também, as variações temporais e espaciais distintas, dependendo das características biofísicas e biogeoquímicas originais da bacia, ao lado do uso da terra presente. Os autores abordam como e porque a bacia hidrográfica deve ser considerada a unidade de estudo primordial nas análises ambientais que visam a conservação de recursos hídricos. São, assim, considerados os processos naturais, o manejo agropecuário, a...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Sustentabilidade ambiental; Bacia Hidrográfica; Uso da Terra; Qualidade da Água; Agricultural watersheds; Watersheds; Land use; Land use change; Water quality.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1112886
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A construção do conhecimento agroecológico no Território Central do Rio Grande do Sul: uma experiência baseada na metodologia campesino a campesino ExtensaoRural
Kaufmann, Marielen Priscila; Pasqualotto, Nayara; Sena, Mauricio Machado.
Primando, sobretudo, pela valorização dos conhecimentos dos agricultores como um aspecto primordial no estudo e compreensão da dinâmica dos agroecossistemas, este artigo apresenta a experiência da utilização da metodologia Campesino a campesino (CAC), para promover a construção do conhecimento agroecológico entre os agricultores ecologistas do Território Central do Rio Grande do Sul. Sob este enfoque, realizaram-se seis oficinas sobre temas recorrentes na produção ecológica de alimentos, tais como a fruticultura, horticultura e pecuária leiteira ao longo do ano de 2015. Ademais, o artigo objetiva analisar as potencialidades e fragilidades do emprego desta ferramenta metodológica no contexto sul-riograndense. Os resultados desta experiência nos indicam que...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Agroecologia; Campesino a campesino; Extensão rural agroecológica; Troca de experiências.
Ano: 2019 URL: http://periodicos.ufsm.br/extensaorural/article/view/39859
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A convergência estratégica em Arranjos Produtivos Locais: uma análise sobre a cooperação entre atores em rede em duas regiões cafeeiras Rev. Econ. Sociol. Rural
Leme,Paulo Henrique Montagnana Vicente; Aguiar,Bruno Henrique; Rezende,Daniel Carvalho de.
Resumo: O desenvolvimento de novos Arranjos Produtivos Locais (APLs) no Brasil é um tema de extrema importância no atual contexto econômico e social brasileiro. As Indicações Geográficas (IG) surgem com o objetivo de proteger e valorizar produtos e serviços típicos de uma região. O resultado é que estes APLs que buscam reconhecimento de origem necessitam desenvolver aspectos ligados à governança local e à coordenação de relacionamentos e interesses diversos. O objetivo deste trabalho foi estudar um APL consolidado na produção de café, o do Cerrado Mineiro, em busca de aspectos estratégicos que expliquem seu sucesso e, através de uma pesquisa-ação, reproduzir as categorias estratégicas encontradas na articulação estratégica da construção da IG da região...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arranjo produtivo local; Convergência estratégica; Origem; Café; Governança.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032019000100145
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A cultura do abacaxizeiro: tradição e inovação. Infoteca-e
REINHARDT, D. H. R. C..
bitstream/item/206501/1/OCR-Reinhardt-DH-Capitulo-5-Livro-Fruticultura-Tropical-UFES-junho2019.pdf
Tipo: Capítulo em livro técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Abacaxi; Inovação.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1116369
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A decision-making framework to reduce the risk of collisions between ships and whales ArchiMer
Sèbe, Maxime; Kontovas, Christos, A.; Pendleton, Linwood.
Ship strikes are one of the main human-induced threats to whale survival. A variety of measures have been used or proposed to reduce collisions and subsequent mortality of whales. These include operational measures, such as mandatory speed reduction, or technical ones, such as detection tools. There is, however, a lack of a systematic approach to assessing the various measures that can mitigate the risk of ship collisions with whales. In this paper, a holistic approach is proposed to evaluate mitigation measures based on a risk assessment framework that has been adopted by the International Maritime Organization (IMO), namely the Formal Safety Assessment (FSA). Formal Safety Assessment (FSA) is “a rational and systematic process for assessing the risk...
Tipo: Text Palavras-chave: Whale; Collision; Ship strikes; Risk assessment; Cost-effectiveness.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/69982/67892.pdf
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A demanda domiciliar por arroz no Brasil: abordagem por meio do sistema Quaids em 2008/2009 Rev. Econ. Sociol. Rural
Zanin,Vanclei; Bacchi,Mirian Rumenos Piedade; Almeida,Aléssio Tony Cavalcanti de.
Resumo O arroz é um alimento básico na dieta do brasileiro; contudo, o lento crescimento de seu consumo tem impactos diretos na expansão do setor. Para compreender os fatores que afetam esse consumo e suas inter-relações com outros alimentos foram estimadas, neste estudo, as elasticidades da demanda por dez alimentos nos domicílios brasileiros, utilizando dados da Pesquisa de Orçamentos Familiares 2008-2009. Para tanto, foi aplicado o modelo Quadratic Almost Ideal Demand System (Quaids) ajustado para o problema do consumo censurado e da endogeneidade das despesas. Os resultados gerais indicam que o arroz apresenta elasticidade-dispêndio menor que a unidade. A elasticidade-renda da demanda reforça esse comportamento de bem necessário, sendo mais elevada em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelo Quaids; Arroz; Demanda domiciliar; Elasticidades.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032019000200234
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A Design and Analysis Methodology for Component-Based Real-Time Architectures of Autonomous Systems ArchiMer
Gobillot, Nicolas; Lesire, Charles; Doose, David.
The integration of autonomous robots in real applications is a challenge. It needs that the behaviour of these robots is proved to be safe. In this paper, we focus on the real-time software embedded on the robot, and that supports the execution of safe and autonomous behaviours. We propose a methodology that goes from the design of component-based software architectures using a Domain Specific Language, to the analysis of the real-time constraints that arise when considering the safety of software applications. This methodology is supported by a code generation toolchain that ensures that the code eventually executed on the robot is consistent with the analysis performed. This methodology is applied on a ground robot exploring an area. Categories (2), (3)
Tipo: Text Palavras-chave: Robotics software; Real-time analysis; Modelling language.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00473/58430/65964.pdf
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A desvalorização cambial e a exportação de produtos florestais madeireiros Rev. Econ. Sociol. Rural
Hersen,Amarildo; Hoeflich,Vitor Afonso; Lima,Jandir Ferrera de.
Resumo O objetivo deste artigo é analisar o comportamento das exportações de produtos madeireiros do setor florestal após a desvalorização cambial, a partir de 2012. O método de avaliação de impacto foi o de diferença em diferenças (DD). Os resultados apontam que, apesar de as exportações representarem, em média, volume menor que a comercialização doméstica, elas tiveram variação absoluta mais expressiva com a desvalorização da moeda brasileira, a partir de 2012. A expressiva queda do real frente ao dólar possibilitou uma trajetória do volume de produtos madeireiros exportados mais positiva que na hipótese de sua inexistência. Contudo, políticas públicas de inclusão do pequeno produtor e empresários do setor madeireiro poderiam ter possibilitado resultados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Setor florestal; Política pública; Política cambial.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032019000300368
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A diagramatic scale to quantify severity of antracnose in Rubus glaucus Benth Ciência Rural
Patiño,Paula Andrea González; Álvarez,Gloria Edith Guerrero; Valencia,Liliana Isaza.
ABSTRACT: Rubus glaucus Benth, commonly referred to as mora de Castilla, is affected by Colletotrichum acutatum, as it induces anthracnose in many of the plant organs. Generally, it affects the fruits during the post-harvest phase and damages them, causing economic losses due to the poor crop quality. At present, no standardized methods are available for this pathosystem that can be used to characterize quantitatively the epidemic and to permit the prediction and comparison of the disease management techniques. In this research, we proposed a logarithmic diagrammatic scale of the severity of anthracnose induced by C. acutatum in the fruits of the thornless variety of R. glaucus Benth. This scale is constructed on the adjustment of the Weber-Fechner law...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Colletotrichum acutatum; Epidemiology; Pathometry; Phytopathometry; Rubus glaucus Benth.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000400150
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A dinâmica dos modelos de negócios para o agronegócio: uma visão bibliométrica de 1956 a 2017 pela Web of Science ExtensaoRural
Silva, João Paulo Nascimento da; Oliveira, Cledison Carlos de; Garcia, André Spuri.
O agronegócio se apresenta como importante fator para economia brasileira e global, sendo assim, este fenômeno se mostra importante para aprofundamento das pesquisas acadêmicas por parte de seu desenvolvimento como modelo de negócios. Através desta pesquisa bibliométrica é possível aprofundar sobre o desenvolvimento deste fenômeno na academia, que, conforme apontam os dados, tem se mostrado de grande interesse para economias como a Brasil e EUA, e que as pesquisas sobre esta temática caminham próximo ao pensamento da economia destes países, conforme apontado pelo apoio dado as fontes de fomento. Dessa forma, este estudo apresenta o fenômeno crescente na economia global, através da pesquisa via Web of Science, e que acompanha o mesmo como desenvolvimento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Comportamento da academia; Economia; Produção..
Ano: 2019 URL: http://periodicos.ufsm.br/extensaorural/article/view/32131
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A dinosaur ilium from the Late Triassic of Brazil with comments on key-character supporting Saturnaliinae Anais da ABC (AABC)
GARCIA,MAURÍCIO S.; PRETTO,FLÁVIO A.; DIAS-DA-SILVA,SÉRGIO; MÜLLER,RODRIGO T..
Abstract: Discoveries in Carnian-aged rocks are establishing a rich and diverse dinosaurian fauna at the so-called ‘dawn of the age of dinosaurs’ in the Late Triassic of Western Gondwana. Accordingly, Brazilian strata from the Candelária Sequence have contributed extensively to this trend. Here, we present a new dinosaurian specimen (CAPPA/UFSM 0200) from this geological unit. The material was collected at a fossiliferous site that had no previous record of dinosaurs. Our specimen comprises a single ilium, which we describe in detail. Its anatomy is consistent with Carnian sauropodomorph dinosaurs, but differs from coeval specimens by several features, although we do not discard the possibility of these features being the result of intraspecific variation....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Intraspecific variation; Saurischia; Sauropodomorpha; Upper Triassic; Western Gondwana.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652019000400516
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A DNA barcode reference library of French Polynesian shore fishes ArchiMer
Delrieu-trottin, Erwan; Williams, Jeffrey T.; Pitassy, Diane; Driskell, Amy; Hubert, Nicolas; Viviani, Jeremie; Cribb, Thomas H.; Espiau, Benoit; Galzin, Rene; Kulbicki, Michel; De Loma, Thierry Lison; Meyer, Christopher; Mourier, Johann; Mou-tham, Gerard; Parravicini, Valeriano; Plantard, Patrick; Sasal, Pierre; Siu, Gilles; Tolou, Nathalie; Veuille, Michel; Weigt, Lee; Planes, Serge.
The emergence of DNA barcoding and metabarcoding opened new ways to study biological diversity, however, the completion of DNA barcode libraries is fundamental for such approaches to succeed. This dataset is a DNA barcode reference library (fragment of Cytochrome Oxydase I gene) for 2,190 specimens representing at least 540 species of shore fishes collected over 10 years at 154 sites across the four volcanic archipelagos of French Polynesia; the Austral, Gambier, Marquesas and Society Islands, a 5,000,000 km(2) area. At present, 65% of the known shore fish species of these archipelagoes possess a DNA barcode associated with preserved, photographed, tissue sampled and cataloged specimens, and extensive collection locality data. This dataset represents one...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00508/61942/66026.pdf
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A economia política do complexo Soja-Carne Brasil-China Rev. Econ. Sociol. Rural
Escher,Fabiano; Wilkinson,John.
Resumo O argumento desenvolvido no artigo, baseado na abordagem dos regimes alimentares, é que a formação do “complexo soja-carne Brasil-China”, a partir do início dos anos 2000, representa uma mudança policêntrica nas relações agroalimentares globais, impulsionada pelos interesses das corporações do agronegócio e indústrias alimentares, bem como dos estados nacionais, em uma direção Sul/Oriente, que desafia o poder estabelecido das grandes corporações transnacionais do Atlântico Norte. Com base na literatura contemporânea em economia política agrária e numa combinação de dados quantitativos e qualitativos, são identificadas as origens, características e dinâmicas do complexo soja-carne Brasil-China através de uma análise comparativa e relacional. Após uma...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Complexo soja-carne Brasil-China; Regime alimentar; Agronegócio; Comércio agrícola internacional; Investimentos diretos externos.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-20032019000400656
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A First Look at Dissolved Ge Isotopes in Marine Sediments ArchiMer
Baronas, J. Jotautas; Hammond, Douglas E.; Rouxel, Olivier; Monteverde, Danielle R..
The removal of chemical species from seawater during the precipitation of authigenic minerals is difficult to constrain but may play a major role in the global biogeochemical cycles of some elements, including silicon (Si) and germanium (Ge). Here, we present Ge/Si, δ74Ge, and supporting chemical data of pore waters and core incubations at three continental margin sites in California and the Gulf of Mexico. We used these data to partition Ge release and uptake by the various allogenic (delivered via sedimentation) and authigenic (formed in situ) phases in these sediments. About half of the pore water Ge (δ74Gepw = 1.3–2.4‰) is supplied by biogenic silica dissolution (δ74Ge ~ 3‰), with the other half contributed by lithogenic particulates (δ74Ge ~ 0.6‰)....
Tipo: Text Palavras-chave: Germanium; Biogenic silica; Authigenesis; Fe oxides; Isotope fractionation; Continental margin.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00504/61556/65466.pdf
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A framework for the development of a global standardised marine taxon reference image database (SMarTaR-ID) to support image-based analyses ArchiMer
Howell, Kerry L.; Davies, Jaime S.; Allcock, A. Louise; Braga-henriques, Andreia; Buhl-mortensen, Pål; Carreiro-silva, Marina; Dominguez-carrió, Carlos; Durden, Jennifer M.; Foster, Nicola L.; Game, Chloe A.; Hitchin, Becky; Horton, Tammy; Hosking, Brett; Jones, Daniel Ob; Mah, Christopher; Laguionie Marchais, Claire; Menot, Lenaick; Morato, Telmo; Pearman, Tabitha R. R.; Piechaud, Nils; Ross, Rebecca E.; Ruhl, Henry A.; Saeedi, Hanieh; Stefanoudis, Paris V.; Taranto, Gerald H.; Thompson, Michael B.; Taylor, James R.; Tyler, Paul; Vad, Johanne; Victorero, Lissette; Vieira, Rui P.; Woodall, Lucy C.; Xavier, Joana R.; Wagner, Daniel.
Video and image data are regularly used in the field of benthic ecology to document biodiversity. However, their use is subject to a number of challenges, principally the identification of taxa within the images without associated physical specimens. The challenge of applying traditional taxonomic keys to the identification of fauna from images has led to the development of personal, group, or institution level reference image catalogues of operational taxonomic units (OTUs) or morphospecies. Lack of standardisation among these reference catalogues has led to problems with observer bias and the inability to combine datasets across studies. In addition, lack of a common reference standard is stifling efforts in the application of artificial intelligence to...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00602/71408/69862.pdf
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